В мире Наруто неспокойно. Повсюду из разных деревень пропадают шиноби, значительная их часть пропадает в области Кири, которое уже сравнительный промежуток времени скрыта от других деревень обильным туманом. Раикаге и Тсучикаге намерены объединиться и напасть на Селение, скрытое в тумане, но предварительно хотят заручиться поддержкой и Конохи с Суной. Но Хокаге не желает развязывать войну (пока еще), она посылает команду шиноби (какую решать нашему Хокаге ) в Кири для исследования существующей там ситуации, Суна сохраняет нейтралитет в этой ситуации. В свою очередь Тсучикаге и Раикаге начинаю подозревать Коноху и Суну в заговоре с Кири. После таинственной пропажи Тсучикаге, конфликт между странами еще больше обостряется. Исчезновение правителя Ивы произошло не просто так, все это дело рук организации Акацуки, которые хотят еще больше подтолкнуть страны к войне, временно заменив похищенного Тсучикаге, на одного из членов организации. Тоже они намеренны сделать и с правителями других стран ...
Наруто возвращается в Коноху, после обучения Джирайей. Саске уже покинул Орочимару, считая, что уничтожил санина, но оказывается нашего Орыча не так то просто убить, неймоверным образом тот избегает смерти и намерен вернуть своего любимого ученика и контейнер для своей души по совместительству...